万国觉醒中同时操控两个部队的核心方法是通过市政厅等级解锁多队列功能，并掌握游戏内置的部队操作技巧。市政厅11级开启第三个队列，17级开启第四个队列，21级开启第五个队列，这是实现多部队操控的基础条件。部队容量的提升还可通过升级武将等级、研究特定技能天赋以及加入联盟获取增益效果来实现。需日落峡谷等特殊玩法中部队基数受规则限制，需通过提升主城等级或使用特定统帅技能来突破限制。
实际操作层面，游戏提供了两种高效的多部队操控方式。第一种是通过长按城市图标并拖拽至目标位置，会弹出部队选择界面，可同时选定多支部队执行统一指令。第二种是双击屏幕右侧的统领栏，可一次性操作所有行军中的部队。这两种方式能显著提升多线作战效率，特别是在资源采集或多人联合作战时。部队行进过程中若需调整路线，可通过点击部队再选择新目标实现即时转向，该操作对多支部队同步生效。
武将搭配对多部队操控具有战略意义。部分统帅如汉尼拔的远征军技能可提升部队容量10%，在外战斗时额外增加15%技能效果；吕布的飞将技能不仅能提升10%部队容量，还能使集结部队容量再提升10%。这类技能可有效增强多支部队的整体作战能力。紫色统帅布狄卡的主动技能可降低敌方怒气值，在双线作战中能起到牵制作用。需注意不同兵种间的攻防属性与相克关系，合理分配部队类型。
联盟协作是扩展多部队战术价值的重要途径。加入活跃联盟后，玩家可通过联盟科技战争召唤提升部队行军速度，并通过联盟领土内的资源点实现多支部队协同采集。在联盟战争期间，集结进攻功能允许玩家同时操控主部队和支援部队，主城等级决定的部队容量将直接影响作战规模。联盟成员间的资源互助也能保障多支部队的持续运作，特别是在长时间作战时需注意资源消耗与补充的平衡。
游戏后期通过黄金之国等特殊活动可检验多部队操控能力。该活动允许预设五支固定编制的部队，在20层关卡中需要分兵应对箭塔守卫和多路线推进。活动中获得的卡鲁拉克祭坛圣物可复活阵亡部队，高级威慑圣物能降低特定守卫60%伤害，这些道具都是维持多支部队持续作战的关键。需注意每层关卡最多携带9件圣物，合理分配使用时机尤为重要。
技术层面优化包括启用手机性能模式确保多部队同屏流畅，以及合理设置游戏画质平衡视觉效果与操作响应。斥候营地升至5级后可自动派出两个斥候探索地图，这种自动化设计能减轻多线操作负担。在设置界面开启部队行进路线显示功能有助于预判多支部队的行动轨迹，避免行军冲突。随着游戏进程推进，建议定期在装备界面检查各部队的武器耐久度，确保多支部队保持最佳战斗状态。
