主将和副将的搭配直接影响战斗胜负。主将的选择优先考虑可控性和爆发力，因为击败敌方主将即可获胜，即使副将兵力耗尽也无妨。主将的胜负决定整支队伍的胜负，因此需要选择能针对敌方主将战术的核心武将。主将若带有专属主将技能，效果会额外增强，比如刘备的虚弱概率提升或董卓的AOE伤害强化。副将则需围绕主将构建，提供保护、增益或补充输出。
根据武将的S、A、B、C适性等级调整属性，优先选择S级适性兵种，能获得120%属性加成。如果三名武将来自同一阵营（魏、蜀、吴、群），还能激活主城科技的10%属性加成。统御值上限为20，搭配时需注意总消耗，避免超限。高统御值的主将（如7点曹操）需搭配低统御副将（如5点郭嘉），确保队伍灵活性。
若主将是输出型（如吕布），副将可选郭嘉提供免控，或黄月英增伤；若主将是防御型（如曹操），副将可搭配程昱补谋略伤害或满宠提供治疗。注意副将战法是否与主将联动，比如锋矢阵能强化主将输出但会降低副将伤害，而八门金锁阵可让主将获得先攻。避免选择会坑队友的副将，比如乐进自带虚弱或文丑禁疗，这类武将可能拖累整体表现。
若敌方擅长斩首战术（如爆头骑），主将应选择高统率或自带减伤的武将（如赵云、程普）；若敌方以控制为主（如蜀智队），副将可带净化或鲁莽免疫负面状态。主将尽量放在队伍左侧，副将居中或居右，利用攻击距离差异规避伤害。主将兵力需保持充足，因为主将阵亡会直接判负，副将则不影响战斗结果。
平民玩家配将时可参考主流阵容思路，但不必强求顶级武将。比如用张角、田丰、兀突骨组成群盾，或吕布、赵云、郭嘉组成突击队，利用低统御武将节省成本。战法优先选择低消耗高收益的类型，比如士别三日、盛气凌敌。开荒阶段主将建议用稳定输出的武将（如孙策），副将搭配治疗或控制（如华佗、法正），逐步过渡到后期阵容。
配将的核心是平衡输出、防御和功能性。主将决定队伍上限，副将决定稳定性，多尝试不同组合才能找到最适合自己的打法。没有绝对完美的搭配，只有最适合当前战场环境的策略。
